La Asamblea General de la UICM, en la que están representados todos los Colegios Profesionales que la integran, se reúne en sesión ordinaria una vez al año. Se caracteriza por la representación paritaria de sus miembros. Es decir, cada colegio tiene plenitud de voto y de representación con independencia del número de colegiados con el que cuente.

Además para el funcionamiento habitual de la UICM, la Asociación cuenta con el apoyo de tres órganos ejecutivos:

Junta Directiva: compuesta por 12 miembros, elegidos por votación en Asamblea General. Establece los objetivos, define las materias comunes de estudio, valora actuaciones ante Administraciones, etc.
 
Secretaría Técnica: en coordinación directa con la Junta Directiva, materializa y pone en marcha las decisiones tomadas por ésta.
 
Comisiones: grupos de trabajo integrados por expertos en distintas materias procedentes de Colegios Profesionales que integran la UICM. En estas comisiones participan, además, al menos un miembro de la Junta Directiva y otro de la Secretaría Técnica.
 
Comisión de Calidad
Comisión sobre la Organización de los Aspectos Deontológicos Profesionales
Comisión de Mediación Familiar
Comisión de Medio Ambiente
Comisión de Prevención de Riesgos Laborales
Comisión de Protección de Datos
Comisión de Sanidad